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非洲企鹅每年都会换羽,脱落磨损的旧羽毛换上新羽毛,以保持羽毛的保暖和防水性能。换羽期间企鹅生活在陆地上三周无法捕猎,因此演化出储存脂肪的机制,利用自身脂肪度过换羽禁食期。换羽之后它需要迅速捕捉食物以恢复体能。如果换羽前后没有找到足够的食物,它们会难以生存。南非研究人员报告,在 2004-2011 年间南非西部沿海的沙丁鱼储量低于其峰值的四分之一(主要原因是过度捕捞),可能导致企鹅因为食物严重短缺而大规模死亡,期间估计有 6.2 万只企鹅死亡。非洲企鹅在 2024 年被列为极度濒危物种。研究人员称其它地区的企鹅种群数量也出现了大规模锐减。过去 30 年企鹅全球种群数量下降了近 80%。